纽约市病毒数据库可能会推动对导致呼吸道疾病严重程度的因素的研究

　　病毒性呼吸道感染是一个重大的公共卫生问题。1月18日，美国纽约哥伦比亚大学的Marta Galanti及其同事在开放获取期刊《公共科学图书馆·生物学》上发表了一项研究，该研究利用纵向队列数据创建了一个交互式的、公开可用的网站——曼哈顿病毒计划:病毒数据浏览器，以可视化队列特征、感染事件和疾病严重程度因素。

　　病毒性呼吸道感染可能导致严重后果。然而，为了开发有效的治疗方法，需要更好地了解宿主反应、宿主基因组成和细菌共感染。

　　为了对影响疾病严重程度的因素进行流行病学研究，研究人员在纽约市进行了一项纵向队列研究，在2016-2018年期间对呼吸道病毒进行了19个月的监测。

　　他们分析了800多个带有临床数据的鼻咽样本，包括214名参与者的自我报告症状。根据这些数据，研究人员创建了病毒数据浏览器，这是一个公开可用的数据库。用户可以访问队列数据，以可视化和分析感染、症状和疾病结果的变化和模式。

　　虽然该数据库共享与感染、症状和基因活性相关的重要队列数据，但该项目有一些局限性。65岁以上的成年人被排除在队列之外，尽管根据作者的说法，呼吸道病毒可能导致“极其严重的并发症，特别是在婴儿、老年人和免疫功能低下的宿主中”。

　　10岁以下儿童的年龄没有分层，模糊了婴儿(另一个高危人群)特有的症状和疾病信息。从研究参与者收集的数据中也没有疫苗接种状况、免疫功能低下状况和感染过程中的药物摄取，这可能限制了病毒组数据浏览器的应用。

　　根据作者的说法，“我们提出了一项由数百个样本组成的队列研究，描绘了由呼吸道病毒感染驱动的转录变化。我们已经汇编了这些数据，以建立一个公开可用的、用户友好的基于网络的资源，任何用户都可以在19个月的时间里纵向比较入组个体的病毒阳性模式、症状和转录组变化。”

　　作者补充说:“这是一篇资源论文，旨在描述宿主对常见且通常无症状的病毒性呼吸道感染的反应。我们收集并提供了一个为期两年的纵向数据集，包括来自纽约市不同年龄组的100多名参与者的分子数据和症状记录。”

　　更多信息:Galanti M, Pati?o-Galindo JA, philip I, Morita H, galanese A, Youssef M，等。病毒组数据浏览器:一个网络资源，纵向探索呼吸道病毒感染，它们与其他病原体的相互作用和宿主转录组变化在100多人。PLoS Biology(2024)。DOI: 10.1371 / journal.pbio.3002089期刊信息:PLoS生物学由公共科学图书馆提供引文:纽约市病毒数据库可能会推进对呼吸道疾病严重程度的影响因素的研究(2024,1月18日)检索自2024年1月19日https://medicalxpress.com/news/2024-01-york-city-virus-database-advance.html本文档受版权保护。除为私人学习或研究目的而进行的任何公平交易外，未经书面许可，不得转载任何部分。内容仅供参考之用。